אגף חינוך בקבה"ד מלווה את מערכות החינוך בקיבוצים ועוסק בהכשרת מנהלים וצוותי חינוך.
בנוסף האגף מקיים מספר סמינרים בשנה לבני נוער בהם מונחלת משנת הקבוץ הדתי לדור ההמשך ונוצרים קשרים חברתיים המעצימים את תחושת השייכות לתנועה.
במסגרת פעילות האגף ניתן גם ליווי אישי למנהלים ומערכות החינוך החברתי וייעוץ מקצועי להובלת תהליכים בתחומי חינוך וקהילה.
תוכנית העבודה לשנת 2025 תכלול בחינה של פעילות האגף והרחבתו לתחומי החינוך הפורמלי בבתי הספר והגיל הרך.